SN2 Reactions with an Ambident Nucleophile: A Benchmark Ab Initio Study of the CN-+ CH3Y [Y = F, Cl, Br, and I] Systems

We characterize the Walden-inversion, front-side attack, and double-inversion SN2 pathways leading to Y- + CH3CN/CH3NC and the product channels of proton abstraction (HCN/HNC + CH2Y-), hydride-ion substitution (H- + YH2CCN/YH2CNC), halogen abstraction (YCN-/YNC- + CH3 and YCN/YNC + CH3-), and YHCN-/YHNC- complex formation (YHCN-/YHNC- + 1CH2) of the CN- + CH3Y [Y = F, Cl, Br, and I] reactions. Benchmark structures and frequencies are computed at the CCSD(T)-F12b/aug-cc-pVTZ level of theory, and a composite approach is employed to obtain relative energies with sub-chemical accuracy considering (a) basis-set effects up to aug-cc-pVQZ, (b) post-CCSD(T) correlation up to CCSDT(Q), (c) core correlation, (d) relativistic effects, and (e) zero-point energy corrections. C-C bond formation is both thermodynamically and kinetically more preferred than N-C bond formation, though the kinetic preference is less significant. Walden inversion proceeds via low or submerged barriers (12.1/17.9(F), 0.0/4.3(Cl), -3.9/0.1(Br), and -5.8/-1.8(I) kcal/mol for C-C/N-C bond formation), front-side attack and double inversion have high barriers (30-64 kcal/mol), the latter is the lower-energy retention pathway, and the non-SN2 electronic ground-state product channels are endothermic (ΔH0 = 31-92 kcal/mol). © 2022 The Authors. Published by American Chemical Society

Ultrafast haplotyping of putative microRNA-binding sites in the WFS1 gene by multiplex polymerase chain reaction and capillary gel electrophoresis.

The transmembrane protein wolframin (WSF1) plays a crucial role in cell integrity in pancreatic beta cells and maintaining ER homeostasis. Genetic variations in the WFS1 gene have been described to be associated with Wolfram syndrome or type 2 diabetes mellitus. In this paper we report on an efficient double-tube allele-specific amplification method in conjunction with ultrafast capillary gel electrophoresis for direct haplotyping analysis of the SNPs in two important miRNA-binding sites (rs1046322 and rs9457) in the WFS1 gene. An automated single-channel capillary gel electrophoresis system was utilized in the method that provided dsDNA fragment analysis in less than 240 s. The light-emitting diode induced fluorescence (LEDIF) detection system enabled excellent sensitivity for automated haplotyping of a large number of clinical samples. The detection limit was 0.002 ng/μL using field amplified injection from water diluted samples. The dynamic quantitation range was 0.08-10.00 ng/μL (R(2)=0.9997) in buffer diluted samples

Ochratoxin A és biodegradációs melléktermékeinek hatása zebradánió (Danio rerio) embriókra

Napjainkra gyorsuló ütemben növekednek azok a potenciális veszélyt hordozó területek nagysága, amelyek ideálisak a mikotoxinok termelődéséhez. Friss kutatások alapján már minden magyaror-szági régióban megtalálhatóak az Aspergillus fajok, így sürgetővé vált a mikotoxin szennyezettség problémájának megoldása. A mikotoxinok ártalmatlanítására számos módszer ismert, melyek kö-zül kísérleteinkben egy biodegradációs eljárás hatékonyságát vizsgáltuk. A mikotoxinok mikrobiá-lis bontása során, bizonyos esetekben a kiindulási anyagnál is toxikusabb melléktermékek képződ-hetnek. Ezeknek a metabolitoknak a biomonitoringjára az EFSA ajánlást adott ki, melyben meg-fogalmazta, hogy a biodegradáció közben keletkező̋ metabolitok biológiai hatását is vizsgálni kell. Korábbi munkáink során kidolgozott mikroinjektálási módszer alkalmazásával egy bizonyítottan Ochratoxin A (OTA) bontó mikrobatörzs minősítését kívántuk elvégezni. Az injektálás során előre meghatározott mennyiségű̋ vizsgálati anyagot juttattunk az embriók szervezetébe, majd 120 órás korban letális végpontra vizsgáltuk őket. A mikrobatörzs minősítésekor a törzstől származó normál és bontott minták teszteredményeit hasonlítottuk össze, az 5 ppm OTA tartalmú oldat eredménye-ivel. A baktériumtörzs 96%-os bontási hatékonyságot mutatott kísérleteinkben. Az eredményeink alapján elmondható, hogy az OTA bontó ŐR 16 jelzésű baktériumtörzs (Cupriavidus Basilensis) termel toxikus anyagokat, azonban ennek toxicitása alacsonyabb az OTA tartalmú oldathoz ké-pest. A baktérium OTA bontási melléktermékei szintén alacsonyabb toxicitást mutatnak a kiindu-lási OTA oldathoz képest. Következtetésként elmondható, hogy az ŐR 16 jelzésű baktériumtörzs alkalmazható lehet zárt térben OTA-szennyezett takarmány detoxifikációjára

Reduced miR-26b Expression in Megakaryocytes and Platelets Contributes to Elevated Level of Platelet Activation Status in Sepsis

L

A tértapasztalat esztétikai, történeti és társadalmi koncepciói a 20. században = Aesthetical, Historical and Social Concepts of Space Experience in the 20th Century

A projekt keretében kiadott fordításkötetek és a hozzájuk kapcsolódó, részben nemzetközi résztvevőkkel szervezett workshopok elsődleges szakmai hozama a térfogalom és a tértapasztalat modern történetének beható interdiszciplináris és módszertani vizsgálata volt, amely három súlypont, az esztétikai tér, a történeti tér valamint a társadalmi és kulturális tér koncepciói köré rendeződött. Ezek elemzése során megmutatkozott, hogy az „esztétikai modernség” vizsgálatát a filozófia, esztétika, társadalomtörténet és kultúratudomány területén egyaránt meghatározza, illetve új szempontokkal gazdagítja a „spatial turn” nyomán végbement általános módszertani váltás. A fordítások révén a kutatás hozzáférhetővé tett olyan központi jelentőségű, idegen nyelvű elméleti írásokat, amelyek elősegítik, hogy a hazai humántudományok közös fogalmi eszköztárral, valamint módszertanilag felkészülten tárgyalják és alkalmazzák a térfogalom és tértapasztalat 20. századi változásai nyomán kialakult térkoncepciókat mind a tudományelméletben, mind pedig az egyes humán diszciplínák terén. | The key result of the translated works and the related workshops partially organized with participants from abroad was that the research conducted in the framework of the project could deliver an in-depth interdisciplinary and methodological analysis of the modern history of the notion and experience of space. The research was arranged in three main topics: different conceptions of aesthetic space, historical space, and social and cultural space were investigated. Their analysis could confirm, that the methodological shift, which was caused by the “spatial turn”, not only affects the way of how “aesthetic modernity” is being examined in the realms of philosophy, aesthetics, social history and cultural studies, but it also enriches these inquiries by adding new aspects to them. By means of the publication and translation activities, the project made important theoretical texts available for the Hungarian academic community working in the field of the humanities. They enable the scientific discourse to use common concepts and thorough methodological principles when studying and applying spatial conceptions, which developed in course of the modifications of the notion and experience of space in the 20th century, both in theory of science and in different disciplines of the humanities

Circulating ACE2 activity predicts mortality and disease severity in hospitalized COVID-19 patients

Objectives Angiotensin-converting enzyme 2 (ACE2) represents the primary receptor for SARS-CoV-2 to enter endothelial cells. Here we investigated circulating ACE2 activity to predict the severity and mortality of COVID-19. Methods Serum ACE2 activity was measured in COVID-19 (110 critically ill and 66 severely ill subjects at hospital admission and 106 follow-up samples) and in 32 non-COVID-19 severe sepsis patients. Associations between ACE2, inflammation-dependent biomarkers, pre-existing comorbidities, and clinical outcomes were studied. Results Initial ACE2 activity was significantly higher in critically ill COVID-19 patients (54.4 [36.7-90.8] mU/L) than in severe COVID-19 (34.5 [25.2-48.7] mU/L; P<0.0001) and non-COVID-19 sepsis patients (40.9 [21.4-65.7] mU/L; P=0.0260) regardless of comorbidities. Circulating ACE2 activity correlated with inflammatory biomarkers and was further elevated during the hospital stay in critically ill patients. Based on ROC-curve analysis and logistic regression test, baseline ACE2 independently indicated the severity of COVID-19 with an AUC value of 0.701 (95% CI [0.621-0.781], P<0.0001). Furthermore, non-survivors showed higher serum ACE2 activity vs. survivors at hospital admission (P<0.0001). Finally, high ACE2 activity (≥45.4 mU/L) predicted a higher risk (65 vs. 37%) for 30-day mortality (Log-Rank P<0.0001). Conclusions Serum ACE2 activity correlates with COVID-19 severity and predicts mortality

Sharp-Wave Ripple Doublets Induce Complex Dendritic Spikes in Parvalbumin Interneurons in vivo

Neuronal plasticity has been shown to be causally linked to coincidence detection through dendritic spikes (dSpikes). We demonstrate the existence of SPW-R-associated, branch-specific, local dSpikes and their computational role in basal dendrites of hippocampal PV+ interneurons in awake animals. To measure the entire dendritic arbor of long thin dendrites during SPW-Rs, we used fast 3D acousto-optical imaging through an eccentric deep-brain adapter and ipsilateral local field potential recording. The regenerative calcium spike started at variable, NMDA-AMPA-dependent, hot spots and propagated in both direction with a high amplitude beyond a critical distance threshold (~150 µm) involving voltage-gated calcium channels. A supralinear dendritic summation emerged during SPW-R doublets when two successive SPW-R events coincide within a short temporal window (~150 ms), e.g., during more complex association tasks, and generated large dSpikes with an about 2.5-3-fold amplitude increase which propagated down to the soma. Our results suggest that these doublet-associated dSpikes can work as a dendritic-level temporal and spatial coincidence detector during SPW-R-related network computation in awake mice